非婚生子亲子鉴定的方法有很多，主要包括单倍体分析、亲子比对分析、DNA指纹分析等。
单倍体分析是目前非婚生子亲子鉴定最常用的方法，它以比较父母和子女在基因座上拥有或没有的基因变异位点来分析亲子关系。通过检测母亲体内是否存在未来胎儿的遗传特征来判断非婚生子和其母亲是否有亲子关系。这种技术在司法鉴定实践中受到广泛应用，准确性非常高。
亲子比对分析是利用比对材料中的13个外显子或十六个外显子的多态性特点，包括STR-VNTR技术、SNP技术和RFLP技术等，结合统计学原理，进行亲子比对分析以证明亲子关系。
DNA指纹分析是根据特定一组位点，用特定技术对检测材料进行比对，以判断母亲与子女是否有亲缘关系。它采用电泳技术，目前被广泛应用于法医学认定亲子关系的实践中。
要进行非婚生子亲子鉴定，需要准备鉴定申请书、家庭成员身份证明和检测受检者的病理材料（如血清、外周血浆、口腔拭子、指甲等），以及受检者的身份证、居住证和户口本等身份证明文件。然后受检者需要到专业检验部门进行择期检测，检验完毕后由受检者提供的身份证明文件前来申请非婚生子亲子鉴定结果，最后，在收到受检人鉴定结果以后，需要到当地户
非婚生子亲子鉴定可采用多种方法。一种是比较方法，包括细胞核型鉴定、血型鉴定、外周血淋巴细胞鉴定、血清因子鉴定和新产生的DNA鉴定等等。另一种是分子生物学方法，如基因分型、胚胎染色体鉴定、核蛋白基因家谱和父系推定等等。有些技术还可以同时进行在细胞水平鉴定和分子水平鉴定，从而更有效地鉴定父系关系。这些方法可以有效鉴定父系关系，结果基本可以达到100%的正确率。
要进行非婚生子亲子鉴定，需要准备由法院依法发放的鉴定令及报告，由有关检测机构出具的检测报告，对当事人进行的表型检测报告等。还需要准备由检测机构出具的样本检测报告，包含细胞核型鉴定、血型鉴定、外周血淋巴细胞鉴定、核蛋白基因表型检测报告等，以及受检者本人的护照、身份证等证件。
测非婚生子亲子鉴定有多种方法，常见的有以下几种。一是采集血液样本，这是较为传统且准确的方式，通过采集鉴定对象的血液，提取其中的DNA进行比对分析。二是采集口腔拭子，使用棉签在口腔内壁轻轻擦拭，获取口腔黏膜细胞来提取DNA。三是采集毛发样本，要带有毛囊的毛发，一般5 - 10根即可。
关于手续，分为个人鉴定和司法鉴定两种情况。如果是做个人亲子鉴定，流程相对简单，无需提供任何证件，委托人可以自行采集样本，然后将样本邮寄或送到鉴定机构，整个过程注重隐私保护，鉴定结果仅对样本负责。
若是做司法亲子鉴定，手续较为严格。首先，需要被鉴定人携带有效身份证件，如身份证、户口本等，到鉴定机构现场办理。其次，要由鉴定机构工作人员现场采集样本，拍照、录指纹等。此外，还需要填写司法委托手续、签字、按手印等。司法亲子鉴定报告具有法律效力，可用于上户口、移民、打官司等司法用途。
