母子亲子鉴定是由法律及医疗机构等机构开展的事业，主要是以鉴定适宜母子血缘关系为目的。为了保证母子亲子鉴定的准确性和权威性，有经验丰富的技术人员和设备进行检测服务，它可以通过母子鉴定样本和血液样本，进行母子基因组的比较，从而进行科学的母子亲子鉴定。
母子亲子鉴定通常由医疗机构和各级公安机关负责，它们通常设有专床医生、营养师和专业检验技术人员，可以进行母子亲子关系的证明。除此之外，工商行政管理部门以及社会福利机构也可以为当事人办理母子亲子鉴定服务。在一些特殊情况下，需要采集特殊样本进行母子亲子鉴定，比如，母子同时拥有多项被比较特征、亲子样本存在污染，都需要采用其他方法收集比较样本，比如组织、凝血样本等。这些特殊情况都要求有专业技术人员进行操作，来确保鉴定结果的准确性。
通常人们在做母子亲子鉴定时，可以通过到专业机构下订单或者预约服务。在中国大陆做母子亲子鉴定的地方一般可以分为权威部门机构、医疗机构、法律机构、专业检验机构。
1、权威部门机构：有的省级或者地级政府部门有着许多真实可靠的母子亲子鉴定报告，可以满足法庭过程中的实际需求。
2、医疗机构：一些大型的三甲医院以及二甲以上的综合性医院，有多家进行母子亲子鉴定的临床检验室，除了单一的检验报告，一般还提供相关的医疗咨询服务。
3、法律机构：在法律方面，有些律师事务所或者司法行政机关提供一站式服务，方便客户进行相关收集和处理。
4、专业检验机构：一些职业医生和相关专家也提供专业的母子亲子鉴定服务，包括材料采集、报告编写等，并且还提供特殊样本的检验服务，如无血样本检测、口腔棉等。
母子亲子鉴定可在具备司法资质的亲子鉴定机构进行，这类机构需持有司法部门颁发的《司法鉴定许可证》，且鉴定项目明确包含法医物证鉴定范畴。需要注意的是，普通医院通常不开展亲子鉴定业务，只有部分具备相关资质和实验室条件的大型医院下属的司法鉴定中心可能提供该服务。
母子亲子鉴定的特殊样本主要是指除血液、血痕、口腔拭子等常规样本外的样本，常见的有：指甲，需采集靠近甲床部分的干净指甲，避免沾染他人DNA；牙刷，需是被鉴定人连续使用超过1个月且未被他人使用过的；口香糖，需是被鉴定人咀嚼15分钟以上的，且需尽快送检；毛发，必须带有完整毛囊的自然脱落头发，不能是剪下来的；精液斑，需提取干净无污染的样本；此外还有烟蒂、羊水（孕期相关，需在专业医疗操作下采集）等。特殊样本的DNA提取难度相对较高，需按照机构要求规范采集，以保证鉴定结果的准确性。
