子女亲子鉴定可以在医院、司法机关检验所、亲子鉴定中心等机构进行。同时，可以提供多种不同类型的亲子鉴定服务。
首先，在医院方面，外科医生会通过做家族病史检查、血液检查、检查婴儿出生前胎儿超声或最新的先天性疾病诊断等，来判断小孩是否有家族遗传病史，以便了解小孩是否存在任何性发育和染色体问题等情况。
其次，司法机关检验所可以看做是法医学实验室，主要提供DNA鉴定、精神图片谱测定等，以确定母亲的DNA，以确保父亲的DNA与孩子的DNA一致，确定其亲子关系。
此外，亲子鉴定中心还提供尿液和唾液鉴定，既可以用于确定母亲，也可以用于确定父亲，综合检测，可以鉴定出孩子与亲子之间的关系。 同时，在孩子出生前准备产前检查，通过检查来确认父亲是孩子的亲生父亲，从而确立孩子与父亲之间的亲子关系，并可以防止遗传性疾病。
进行小孩亲子鉴定时，可选择的机构类型需符合法律及专业规范要求。通常，具备司法鉴定资质的机构可开展此类鉴定，具体包括经司法行政部门审核登记的司法鉴定中心等。需注意，个人亲子鉴定若用于非司法用途，部分机构也可提供服务，但需明确其是否具备相应的技术能力和资质。
在准备材料方面，不同类型的鉴定（司法或个人）要求有所不同。若用于司法用途（如落户、诉讼等），需提供被鉴定人的身份证明文件（如户口本、身份证、出生证明等），并确保所有被鉴定人在场，由机构安排采样并进行身份核验。若为个人用途，一般需提供被鉴定人的样本（如血液、口腔拭子、毛发等），但具体材料要求以实际选择的机构告知为准，建议提前与机构沟通确认。
无论选择何种机构，均需确保其具备合法资质和专业能力，避免选择无资质的机构，以保障鉴定结果的准确性和有效性。在采样过程中，应遵循专业指导，确保样本质量符合检测要求。如有疑问，可向当地司法行政部门咨询，获取合规机构的名单及相关要求。
