父子亲子鉴定可在民政部门出具鉴定书，或者可以在法院出具判决书。要做父子亲子鉴定，需要准备的证件如下：
1、准备相关人的身份证，若儿童年龄未满16周岁，需要准备出生证明或户口本，提供个人身份信息；
2、办理人的父子亲属关系调查材料，包括双方的家谱、户籍资料、婚记、房产以及有关的票据、协议、见证人的证明等；
3、双方的照片、体格检查报告和中国原版亲子关系检测报告；
4、双方的婚姻证明，如果一方未结婚，可以提交有关法律文件；
5、其他有关材料，包括外省父子亲属关系鉴定结论书（父子及同类亲属关系）和收养证明等。
以上是需要准备的材料，任何情况下，准备的材料越多就越有利于通过鉴定。做父子亲子鉴定可以咨询当地的人民法院，或者自己去民政部门了解相关规定，根据要求准备上述文件，即可申请办理父子亲子鉴定。
进行父子亲子鉴定，应当前往具备司法鉴定资质的专业司法鉴定中心。这类机构需持有省级司法行政机关颁发的《司法鉴定许可证》，且其核准的业务范围中必须包含“法医物证鉴定”。普通医院一般不开展此类对外业务，只有极少数特定医院内部设有此类中心，因此务必选择正规合法的鉴定机构以确保结果准确。
关于所需证件，这取决于鉴定的具体用途。如果是司法亲子鉴定，通常用于上户口、移民、入学或法律诉讼等，具有法律效力。此时，所有被鉴定人必须亲自到场。需要提供有效身份证件，如身份证、户口本、出生证明等原件及复印件。工作人员会现场核对身份、录指纹并采样拍照，整个过程具有严格的法律程序性。
如果是个人隐私亲子鉴定，仅用于个人了解真相，结果不具备法律效力，则对证件要求较为宽松。被鉴定人无需提供证件，可以自行采样邮寄，也可以匿名现场办理。但在选择机构时，仍需确认其具备相应的实验能力和专业资质，以保证检测数据的科学性。
