一般来说，法庭司法亲子鉴定的方法有DNA分型测定、血清学检测、比对血液成分和其它体液成分等技术手段。
DNA 分型测定是目前最可靠的方法，它以比较不同人在基因序列上的差异为基础，以计算机处理完成相应测定。 法庭司法亲子鉴定由于能排除以外种基因性状差异，因此能准确排除或证实亲子关系。
血清学检测主要用来测定不同血型的比较，例如母亲的ABO血型和婴儿的血型，也可以用来测定血型细节，例如亲子之间的质体差异。
比对血液成分和其它体液成分，可以用来检测氨基酸、碳水化合物等多种成分，可以用来区分不同人在基因型、血清学表型等方面的差异。
按照中华人民共和国《民事诉讼法》规定：当事人可以申请法庭指定司法亲子鉴定机构，办理司法亲子鉴定，并且可以在亲子关系存疑的情况下申请法院发起司法亲子鉴定程序，并由司法机关强制执行。当事人可以就司法亲子鉴定的结果向人民法院提起异议，要求变更鉴定结论。
司法亲子鉴定主要通过DNA鉴定技术完成，具体方法包括：使用血液、口腔拭子、带毛囊的毛发、指甲等样本，提取DNA后进行基因位点检测与比对，通过分析遗传标记的匹配程度确定亲子关系。样本采集需遵循严格规范，通常由鉴定机构专业人员现场采集，以确保样本来源的真实性和可靠性，避免样本污染或替换。
法律要求方面，首先需确保鉴定机构具备司法资质，即获得司法行政管理部门批准的《司法鉴定许可证》，鉴定人员需持有司法鉴定人执业证。其次，鉴定需遵循自愿原则（涉及未成年人等特殊情况需监护人同意），相关当事人需携带有效身份证件（如身份证、户口本、出生证明等）到现场办理，填写委托书并签字确认。此外，鉴定过程需符合法定程序，鉴定报告需加盖司法鉴定专用章，方可作为司法证据使用，适用于户口登记、抚养权纠纷、遗产继承等法律场景。若涉及诉讼案件，鉴定机构的选择可能需经法院指定或双方协商确定，以保证鉴定结果的法律效力。
