做上户口亲子鉴定可以通过比较和分析亲子关系的几种基因检测技术来确定。目前常用的技术应用在亲子鉴定中有： 1、指纹图谱：指纹已经被认为是最可靠的人类识别方法，它能有效地辨别出亲缘关系。这种技术在亲子鉴定中被广泛使用，因为父母的指纹图谱会与孩子的指纹图谱十分相似，可以有效鉴定出亲子关系。 2、血型：血型可以准确地判断出具有血缘关系的两者之间的可能性，因此也可以用于亲子鉴定。不同性别的父母会有不同的基因，可以根据这些基因来判断父母和孩子之间的血缘关系。 3、基因分型：全基因组分析和基因分型可以得到在基因变异，等位变异以及其它形式的比较等方面的最终结果，从而准确的确定出亲子关系。 4、 DNA检测：DNA检测可以非常准确地指明某人是否为某位亲属的侄子或孙子，通过比较和分析双方DNA序列，精确地辨别出亲子关系。
这四种技术都可以用于上户口亲子鉴定，都是可靠的技术被广泛使用。不过，如果要得出正确的结论，就必须先对比检测双方的血液或其它样本，然后对基因检测的结果进行确认和判断，最后才能准确地确定出亲子关系。
上户口亲子鉴定属于司法鉴定范畴，其报告具有法律效力，因此对样本的采集有严格规定。为了确保鉴定结果的法律有效性，所有被鉴定人必须携带有效身份证件亲自到鉴定机构现场，由专业人员按照规范程序采集样本，严禁邮寄或私下送检。
现场采集的常规样本主要包括静脉血和口腔拭子。静脉血样本DNA含量高，是传统的检测材料；口腔拭子通过采集口腔黏膜脱落细胞获取DNA，具有无痛、便捷的优势。虽然带有毛囊的头发也可作为样本，但通常建议优先使用前两者。像烟头、牙刷、口香糖等个人生活用品，因无法证明样本来源的真实性，通常不被接受用于此类鉴定。
在技术层面，目前司法亲子鉴定普遍采用STR分型技术结合PCR扩增技术。STR即短串联重复序列，具有高度多态性。检测过程通常会对20个或更多基因座进行检测，通过比对父母与子女的基因分型数据，计算亲权指数。该技术科学严谨，认定亲权关系的准确率极高，是目前国际公认的标准检测方法。
